Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms