Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Hoxd10P28359 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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