Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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