Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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