Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp20Q8C6M1 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms