Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms