Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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