Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DmdP11531 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DmdP11531 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DmdP11531 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms