Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxb2P0C1T1 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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