Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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