Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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