Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Use1Q9CQ56 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms