Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Uhrf1Q8VDF2 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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