Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Nop53Q8BK35 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Nop53Q8BK35 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop53Q8BK35 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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