Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc88cQ6VGS5 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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