Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 AC164437.4-202ENSMUST00000228794 2413 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Itgb2l-202ENSMUST00000113773 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sox12Q04890 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Wdpcp-201ENSMUST00000020568 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sox12Q04890 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms