Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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