Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd10P28359 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms