Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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Ccl20O89093 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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