Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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H2-M1F7CXU4 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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H2-M1F7CXU4 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-M1F7CXU4 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
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H2-M1F7CXU4 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-M1F7CXU4 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-M1F7CXU4 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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