Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Speer3W4VSP1 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms