Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Col5a3Q9JLI2 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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