Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms