Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp16Q99LG0 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms