Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc18Q640L5 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms