Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ctdnep1Q3TP92 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ctdnep1Q3TP92 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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