Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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