Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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