Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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