Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DmdP11531 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
DmdP11531 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DmdP11531 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DmdP11531 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms