Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Spta1P08032 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Spta1P08032 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390.6 ms