Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms