Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms