Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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