Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms