Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
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