Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ttc21bQ0HA38 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ttc21bQ0HA38 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ttc21bQ0HA38 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ttc21bQ0HA38 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ttc21bQ0HA38 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ttc21bQ0HA38 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ttc21bQ0HA38 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms