Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms