Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nfkb1P25799 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms