Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
DmdP11531 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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DmdP11531 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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DmdP11531 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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DmdP11531 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DmdP11531 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms