Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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