Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms