Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnft1Q9DCN7 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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