Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms