Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VgfQ0VGU4 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VgfQ0VGU4 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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VgfQ0VGU4 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VgfQ0VGU4 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VgfQ0VGU4 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VgfQ0VGU4 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VgfQ0VGU4 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VgfQ0VGU4 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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VgfQ0VGU4 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VgfQ0VGU4 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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