Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms