Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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