Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms