Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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