Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms